词汇表:代谢与酶
代谢与酶一章的关键术语,每个术语以三种语言定义。
本章术语的语境
第五章以五个描述细胞如何控制化学反应速度与方向的术语为核心:代谢、酶、底物、活性部位与变性。代谢是生物体内所有化学反应的总和,分为两个相反的类别,合成代谢,由较小分子构建较大分子,需要消耗能量,例如由氨基酸合成蛋白质;以及分解代谢,把较大分子分解为较小分子并释放能量,例如呼吸作用分解葡萄糖。此后各章讨论的每一个反应,从消化到光合作用再到呼吸作用,都是代谢反应,因此本章是整个课程的概念枢纽。
酶是一种生物催化剂,是一种能加快特定化学反应速率,而自身不会被消耗或永久改变的蛋白质。由于酶是蛋白质,其功能完全取决于其三维形状,这正是活性部位变得至关重要之处:活性部位是酶表面的特定区域,其形状只与一种特定底物,即酶所作用的物质,相配,这种关系被描述为“锁与钥匙”模型,在SPM层级更精确的说法是“诱导契合”模型,即活性部位在底物结合时会稍微改变形状以贴合底物。这正是为何一种酶通常只催化一种类型的反应,这一特性称为专一性,而一个常见的误解是把酶当作泛用型反应加速剂,而非底物专一的蛋白质。
变性描述的是当酶暴露于过高的温度或偏离其最适pH值太远时发生的现象:维持酶三维形状的化学键断裂,活性部位的形状被永久扭曲,酶不再能结合其底物,这种改变一旦发生,即使把酶放回正常条件,也无法逆转。学生非常容易把变性与单纯的“速率减慢”混淆,但两者是不同的过程,对应不同的图形:随着温度升高趋向最适温度,酶活性因粒子移动与碰撞加快而提高,但一旦温度超过最适温度,活性会急剧且永久下降,因为酶已经变性,而不仅仅是变慢。
温度与pH的图形通常都呈现先上升到最适值的峰值、再在高值一侧急剧下降的曲线,考官常要求考生具体从变性的角度解释曲线下降的部分,而不是笼统地写“速率下降”。这一区别,低温造成的可逆减慢(此时分子只是移动得较慢,回暖后可再次加快)与变性造成的不可逆活性丧失,是本章最常被考查的观念之一,并会在第三卷有关淀粉酶与胃蛋白酶的实验题,以及第二卷结构题中反复出现。
- 酶
- 由蛋白质构成的生物催化剂,可加速特定化学反应而本身不被消耗。
- 底物
- 酶所作用、以生成产物的特定分子。
- 活性部位
- 酶上具有特定形状、与底物结合的区域。
- 变性
- 通常因高温或极端 pH 导致酶形状永久改变,使其无法再与底物结合。
- 新陈代谢
- 生物细胞内进行的所有化学反应的总和,包括同化作用与异化作用。
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